После русского этноса в этом регионе практически равным количеством представлены татары и башкиры, традиционно исповедующие ислам. Именно с их деятельностью связано современное состояние ислама на Южном Урале. Исламизация территории современной Челябинской области началась в период Золотой Орды, которая официально приняла ислам в XIV веке.
По состоянию на начало 2019 года в регионе официально работают 105 мусульманских организаций. 74 из них относятся к Центральному Духовному управлению мусульман, 28 действуют в автономном режиме. И только 3 структуры связаны с Духовным управлением мусульман РФ.