Численность мусульман в Магаданской области небольшая. Всего их насчитывается около 3600 человек. Это татары, башкиры, узбеки, азербайджанцы, ингуши, казахи. Появление мусульман на этих землях Дальнего Востока происходило в советский период и после распада СССР, хотя первые последователи ислама были замечены здесь ещё во второй половине XIX века.
В настоящее время в Магаданской области зарегистрирована одна мусульманская организация, которая относится к Центральному Духовному управлению мусульман. Она появилась в 1990-е годы и носила первоначально также национально-культурный, а не только религиозный характер. Важную роль в её возникновении сыграли татары и башкиры.