В дореволюционные и советские времена ислам на территории Вологодской области не был сильно представлен. Уже в постсоветский период формируется мусульманская община и начинает свою бурную деятельность, связанную, прежде всего, с открытием мечетей и просвещением жителей области об исламских ценностях и традициях.
Ислам в регионе развивается благодаря представителям таких народов, как татары, азербайджанцы, чеченцы, киргизы, узбеки, таджики. Численность общины составляет 7 000 человек. В регионе зарегистрированы две мусульманские организации, которые находятся в юрисдикции Духовного управления мусульман РФ.