История ислама в Краснодарском крае восходит к XIV-XV векам, когда Османская империя установила контроль над этими землями. Но после того, как Кубань перешла под контроль российского государства, исламизация региона прекратилась.
Традиционно эту религию в крае исповедуют адыгейцы, турки-месхетинцы, азербайджанцы, курды, чеченцы, татары. Их численность составляет почти 100 тысяч человек. В регионе функционируют 6 мусульманских организаций. 4 из них входят в автономное Духовное управление мусульман Республики Адыгея и Краснодарского края. Одна организация действует автономно. Имеется также местный приход, находящийся в юрисдикции Духовного управления мусульман РФ.