Ввиду значительного территориального удаления от мест, где традиционно проживают мусульмане, исламское вероучение начало проникать на территорию современного Хабаровского края только в конце XIX века. В настоящее время самую молодую мировую религию исповедуют представители татарского, узбекского, азербайджанского, башкирского и других народов. Всего так называемых «этнических» мусульман в регионе насчитывается около 20 тысяч человек.
В Хабаровском крае зарегистрировано 8 мусульманских организаций. Из них шесть относятся к Центральному Духовному управлению мусульман страны, остальные – к Духовному управлению мусульман РФ.