Первые мусульмане появились на территории современной Еврейской автономной области в 1856 году, когда до этих земель добрались забайкальские казаки, в составе которых были также башкиры и татары. Новый импульс исламское вероисповедание в регионе получило уже в XXI веке, когда в Биробиджане была введена в строй Соборная мечеть.
Примерная численность представителей народов, традиционно исповедующих ислам, составляет 2300 человек. Это татары, азербайджанцы, таджики, башкиры и другие. В автономной области зарегистрирована одна мусульманская организация, которая относится к ЦДУМ.